电视剧《甄嬛传》后，神奇的香料秘籍让网上挑刺声一片；包括纪连海在内的多位历史学家纷纷质疑，疾呼“别把电视剧当历史”、“不要观众”；安徽卫视等平台，更开辟节目和讲坛“理清甄嬛背后的真假”。
为了符合清史，剧集将原著中的“清河王”改成“果郡王”。名字虽是套上了，但人物故事却不相符——史书中的十七阿哥允礼虽然也是英俊倜傥、聪明好学，但并不那么“闲云野鹤”、不理朝政。
纪连海称，雍正让允礼掌管理藩院，处理民族事务，后封为果亲王，掌管户部。剧中果郡王为了甄嬛，喝下雍正的毒酒；实际上，允礼死的时间是乾隆三年(1738年)，在雍正死后三年多才死的。
剧中，雍正除了蔡少芬演的皇后外，之前还有过一位“纯元皇后”，此女是雍正的挚爱，可惜死得早。清史专家佟悦说，根据他对史料的研究，雍正在位时仅有一位皇后，即乌喇那拉氏。她在雍正即位之前是嫡福晋，在雍正元年被封为皇后，雍正九年去世，尊号为孝敬宪皇后。雍正对她非常尊敬，经常夸赞她贤德淑惠。剧中，乌喇那拉氏宜修为庶出，她的姐姐纯元是嫡出，曾是雍正的皇后。纪连海表示，他没在满清史料中查到有“纯元皇后”，倒是朝鲜出现过一位“纯元皇后”。
甄嬛和《宫2》中的怜儿一样，原型都是雍正的妃子、乾隆的生母、孝圣宪皇后钮祜禄氏。据史载，钮祜禄氏生下乾隆后地位未获提升，十余年间并不受宠；直到年妃、皇后离世，地位才日渐提高。雍正八年晋为熹贵妃，为雍正朝后期后宫者。
对于剧中“生母变养母”、跟果郡王玩暧昧等情节，佟悦表示，这纯属虚构，“钮祜禄氏被史学家称为‘历史上最幸福的太后’，乾隆对她非常孝顺，钮祜禄氏八十大寿时，乾隆年已六旬，却为母亲跳了一段舞蹈。乾隆曾4次到沈阳，其中两次都带着钮祜禄氏”。