战国时代，风起云涌，是中国历史上最浪漫的时代之一。而“寻秦记”故事，也正发生于这个多姿多彩、英雄辈出的时代。故事开始，是在廿一世纪的未界，特种部队精英项少龙，机智过人，身手不凡，被选中参与一项神秘计划。有关，多年以来一直进行秘密研究，终于完成全世界第一部时空穿梭机。项少龙在千挑万选之下，终成为首位穿梭时空的实验者。
项少龙展开他的划时代的旅程，回到两千多年前，亦即是战国时代的中国，秦王嬴政登基那年的咸阳城。岂料时空穿梭机突然发生故障，项少龙被送至秦王嬴政登基前一年的赵国。项少龙孤身赵国，为了可以回到未来，决意不顾一切，也要找到当时尚未继位，仍在赵国被，过着质子生活的嬴政，助其建立一番伟大功业。